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)i( Thématique
 

Bioinformatique

Domaine de recherche récent, qui associe la biologie moléculaire à l'informatique et aux mathématiques, la bioinformatique cherche à faire progresser les connaissances sur le fonctionnement des organismes vivants. Génomique et post-génomique offrent aux chercheurs de nombreuses pistes à explorer, de nombreux problèmes à résoudre. Le contenu des documents de cette thématique a été élaboré avec François Rechenmann, chercheur à l'INRIA Rhône-Alpes.

 
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Découvrir  

À propos du séquençage de génomes  

François Rechenmann   Joanna Jongwane  -  28/06/2010

L’efficacité actuelle des techniques de séquençage de l’ADN permet des projets à grande échelle. François Rechenmann en parle dans cet épisode du podcast audio.

 
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La molécule sur écran

Pierre Tuffery  -  16/04/2010

Comprendre les maladies au niveau moléculaire, afin de concevoir des médicaments mieux ciblés, est l’une des principales retombées attendues de l’analyse de la structure tridimensionnelle des molécules biologiques.

 
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Décoder le vivant

Jacques Nicolas  -  12/03/2010

Pour étudier un organisme vivant, le biologiste dispose du séquençage de son génome. Cette séquence d’ADN est le support de l’information génétique, clé du développement et du fonctionnement de l’organisme.

 
De la recherche  

Des peptides à explorer  

Maude Pupin  -  11/03/2010

Connaissez-vous les peptides non-ribosomiques, ces petites protéines qui ne sont pas synthétisées par la voie classique ? Une base de données dotée de mécanismes d'interrogation spécifiques leur est dédiée.

 
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Idée reçue : La bioinformatique, c’est l’analyse du génome humain

François Rechenmann  -  16/09/2009

Avez-vous idée de la diversité de ce domaine de recherche, à l’interface de la biologie et de l’informatique ?

 
De la recherche  

L’Annotathon : une plate-forme collaborative d'annotation de séquences biologiques

Carl Herrmann  -  03/06/2009

La bioinformatique offre aux biologistes des outils informatiques de nouvelle génération.

 
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Idée reçue : Le génome humain est complètement décrypté

François Rechenmann  -  06/04/2009

La quasi-totalité de la succession des nucléotides constituant les macromolécules d’ADN humaines – le génome – est connue et disponible sous la forme d’un texte long de près de 3 milliards de lettres. Encore faut-il réussir à interpréter ce texte !

 
Ludique  

10 questions sur la bioinformatique

François Rechenmann  -  15/09/2008

Que savez-vous de ce domaine de recherche à l’interface de la biologie moléculaire, de l’informatique et des mathématiques ?

 
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Entre biologie, informatique et mathématiques : la bioinformatique

Isabelle Quinkal   François Rechenmann  -  22/03/2004

À l’interface entre biologie, informatique et mathématiques, la bioinformatique analyse et interprète, au moyen de méthodes informatiques, les données biologiques que sont les séquences des gènes et des protéines cellulaires.

 
De la recherche  

À la recherche de régions codantes  

François Rechenmann  -  15/09/2006

Mouche, homme, souris, chimpanzé, chien… les annonces de la disponibilité du texte complet de génomes se succèdent. Mais disposer d’un texte est une chose, l’interpréter en est une autre. Les informaticiens et biologistes travaillent conjointement à la conception d’algorithmes dédiés à l’analyse de ces milliards de lettres.

 
Ludique  

Symbiologik : jouez avec les gènes

Nicolas Deroche   Mathieu Giraud  -  06/06/2006

Ce jeu vous propose d’expérimenter trois tâches parmi les plus courantes en bioinformatique : l’assemblage de fragments d’ADN, la recherche de motifs communs à plusieurs protéines, la construction d’arbres phylogénétiques.

 
Itinéraires  

Christian Gautier, un pionnier de la bio-informatique

Anne Lefèvre-Balleydier  -  15/12/2005

Aimant la biologie, tout en s’avérant brillant en mathématiques, Christian Gautier s’est orienté vers la recherche en bio-informatique, dans le domaine de la génomique. Dans cet entretien, ce directeur du Laboratoire de biométrie et biologie évolutive revient sur les étapes marquantes de son parcours et ses recherches actuelles.

 
Approfondir  

Alignement optimal et comparaison de séquences génomiques et protéiques  

François Rechenmann  -  03/10/2005

La comparaison de séquences génomiques et protéiques est la tâche informatique la plus exécutée par les biologistes. Des algorithmes sont mis en œuvre pour calculer les meilleurs alignements entre plusieurs séquences.

 
De la recherche  

La bioinformatique en protéomique : analyse des spectres de masse

François Rechenmann   Isabelle Quinkal  -  01/02/2005

La protéomique désigne l’étude de toutes les protéines exprimées à partir d’un génome. Ce champ d’investigation est immense, et nécessite des outils adaptés à l’ampleur du travail. Des outils dans lesquels la composante informatique est toujours essentielle.

 
De la recherche  

Accélérer l’exploration et l’analyse des textes des génomes

Dominique Lavenier  -  06/01/2005

Le volume d’information stockée dans les banques de données génomiques double chaque année, alors que les performances des ordinateurs progressent moins vite. D’où la nécessité de mettre au point des architectures spécifiques dédiées à l’exploration de ces banques.

 
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Vous n’auriez pas vu un gène, par hasard ?

Isabelle Quinkal   François Rechenmann  -  18/03/2004

Une molécule d’ADN est une longue chaîne, une succession de nucléotides dont l’ordre – la séquence – permet de coder l’information génétique de chaque organisme vivant. Cette séquence est au centre de la génomique.

 
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La post-génomique ou les mystères de la cellule

Isabelle Quinkal   François Rechenmann  -  18/03/2004

La post-génomique permet d’étudier quand et dans quelles conditions un gène s’exprime pour enclencher la fabrication de protéines, et l’activité des protéines fabriquées. Des recherches allant de pair avec la bioinformatique...

 
De la recherche  

Bioinformatique et protéomique

Alain Viari  -  18/03/2004

Si la génomique vise l’étude systématique des gènes, la protéomique vise l’étude systématique des protéines. Cet exposé décrit les grandes lignes d’une approche originale développée par le CEA et l’INRIA.

 
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Glossaire bioinformatique

Isabelle Quinkal  -  01/02/2004

Quelques termes-clef de biologie moléculaire et leur définition.

 
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