La post-génomique permet d'obtenir ce type d'informations à travers l'étude du transcriptome et du protéome. Ces termes, créés il y a une dizaine d'années par analogie avec le mot « génome », définissent respectivement l'ensemble des ARNm et des protéines que produit le génome à un moment et dans des conditions donnés. De nouveaux domaines de recherche qui ne peuvent être envisagés sans la bioinformatique...

Le fonctionnement cellulaire, de l'ADN aux protéines. © ORNL - U.S. Department of Energy Human Genome Program

1. Analyser le transcriptome

Le génome est le même dans toutes les cellules d'un organisme donné, et la machinerie cellulaire tente de le maintenir inchangé en réparant les mutations qui peuvent y être générées. Par contre, le transcriptome varie selon le stade de développement de la cellule, le type de cellule et sa situation physiologique (état sain ou pathologique).

Puce à ADN : Chaque ARNm exprimé par la cellule est représenté par un point (image CEA).

Ainsi, le transcriptome est dynamique. L'analyser consiste à identifier, à un temps t, les séquences codantes du génome qui sont effectivement exprimées. L'étude du transcriptome repose en particulier sur la technologie des biopuces, ou puces à ADN , qui cherche à détecter les ARNm présents dans un mélange donné. Plusieurs dizaines milliers de résultats peuvent être obtenus simultanément. Comme pour le séquençage du génome, les données sont produites en masse, nécessitant un traitement des résultats faisant intervenir la bioinformatique.