Phylogénie

Une espèce S1 peut subir à un moment donné de son histoire une spéciation ; elle donne naissance à deux nouvelles espèces S2 et S3. Décrire la phylogénie entre ces trois espèces consiste à dire que S1 est l’ancêtre commun à S2 et S3. Une représentation simple est un arbre avec une racine S1 et deux feuilles S2 et S3. On peut répéter ce raisonnement lorsque l’on a plusieurs espèces actuelles et construire ainsi un arbre dont elles sont les feuilles.